La villa de Bergara nació en el siglo XIII en torno al lugar en el que se ubica la parroquia de San Pedro de Ariznoa.
El templo que hoy admiramos se construyó sobre los cimientos de una iglesia anterior, a lo largo de cuatro campañas de obras que se desarrollaron entre las últimas décadas del siglo XV y el año 1620.
La esbelta y bella torre barroca (1742) se debe al arquitecto José de Lizardi; es, sin duda, una de sus mejores realizaciones. Entre las numerosas obras artísticas que engalanan el interior del templo mencionaremos el retablo mayor plateresco (1535-1540), uno de los primeros retablos renacentistas construidos en el País Vasco. Del siglo XVII es el Santo Cristo de la Agonía, situado en la capilla homónima bajo el coro.