Les catacombes de Domitilla seraient le cimetière privé de la nièce de l'empereur Domitien (81-96), appartenant à la riche famille des Flaviens. En 95, le mari de Domitilla, Flavius Clément, fut dénoncé pour s'être converti au christianisme et exécuté sur ordre de Domitien. Domitilla fut envoyée en exil sur l'île de Pandataria (aujourd'hui île de Ventotene). Les catacombes abritent l'église des saints Nérée et Achillée, érigée entre 390 et 395.